La période de 1980 à 1990 qui fut marquée par d’intenses activités organisationnelles tant au niveau des structures qu'à celui des programmes pédagogiques et scientifiques et par le renforcement et la diversification de la coopération internationale avec le Nigéria, la Belgique, la France, les Pays-Bas, l’Institut International d’Agriculture Tropicale (IITA), la Fondation Ford, etc...

La période de 1990 à 2007 qui est marquée par la consolidation des structures, des programmes et des mécanismes mis en place (infrastructures diverses, équipements pédagogiques et scientifiques, formation initiale, formation post-universitaire, formation continue, formation des formateurs, recherche scientifique, appui au développement…).

Période de 2007 à nos jours marquée par le démarrage du système Licence Master Doctorat (LMD) à la FSA et une profonde restructuration administrative et pédagogique de la formation et des services la Faculté.